Per molto tempo, le origini della coltivazione del cacao sono state associate soprattutto alla Mesoamerica. Le ricerche archeologiche condotte a Santa Ana–La Florida, nell’attuale Ecuador, hanno però individuato tracce dell’uso del cacao risalenti a circa 5.300 anni fa.
I ricercatori sono arrivati a questa conclusione attraverso tre tipi indipendenti di prova: granuli di amido, residui di teobromina e DNA antico. L’Alta Amazzonia emerge così come il più antico centro finora conosciuto di uso e domesticazione del cacao.